档案馆成立于2011年4月，正处级建制，为江西省高校档案工作研究会会长单位。档案馆前身是1991年成立的综合档案室。现有正式编制5人，部门档案负责人57人，部门专（兼）职档案员57人。档案馆秉着对历史负责、对未来负责、对事业负责、对民众负责的态度，承担为现实服务、为社会服务、为发展服务的三大服务职能。我馆于2011年5月获得江西省档案局颁发的档案工作规范化管理省一级单位，并已建设成为学校档案安全保管基地、爱校教育基地、档案利用中心、档案信息查阅中心、电子文件中心等“五位一体”的档案馆。
档案馆总建筑面积456平方米，设有人事档案和学生档案两个分室。其中库房面积306平方米，阅档室面积46平方米，办公室面积102平方米。档案馆库藏我校1978年恢复建校以来的档案和资料，包括党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版、外事、财会、声像、实物、人事、学生等十三个门类的档案。现在案卷3万余卷，2万余件。
取得的主要成绩：
2007年江西省高校档案工作检查评估“良好”单位（省教育厅颁发）
2008-2009年全省高校档案工作先进集体（省教育厅颁发）
2008年《南昌工程学院年鉴》入选全省优秀档案编研成果三等奖（省档案局颁发）
2010年省直单位档案工作先进集体（省档案局颁发）
2010-2011年江西省高校档案工作先进集体（省教育厅颁发）
2014-2015年江西省高校档案工作先进集体
2016-2017年江西省高校档案工作先进集体
